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2004年淮河流域大洪水时，他带领团队利用合成孔径雷达成像技术为抗洪救灾提供大量第一手资料。
2008年，吴曼青院士团队成功研制出中国首套机载雷达测图系统，投入使用后获取中国西部横断山脉11万平方公里雷达影像，填补该地区地图空白，使我国成为世界上少数几个掌握雷达测绘技术的国家之一。
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吴曼青主持论证了“天地一体化信息网络”这一重大科技工程，使之成为首批启动实施的四个“科技创新2030重大项目”之一，并组织开展了工程方案的论证与实施。
吴曼青主导了“社会安全风险感知与防控大数据应用”国家工程实验室的建设，探索以国家需求为导向、技术创新为驱动、产业化发展为联动的新路径。
吴曼青院士全力推进“物联、数联、智联”战略，通过全面覆盖与感知、数据整合与洞察、共创共治与共享，实现数据的流动与服务的开放，赋能城市治理。
吴曼青院士带领团队成功研制拥有完全自主知识产权的“魂芯一号”，打破国外高端数字信号处理芯片对我国高性能计算领域的垄断。
新冠肺炎疫情期间，吴曼青院士团队汇聚多方数据，研发成功密切接触者测量仪和“一网畅行”大数据系统。
在国务院联防联控机制中，吴曼青院士担任关键职务，为疫情预测、防控及复工复产提供有力支持。
他领衔的疫情防控大数据攻关团队获得“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号。
