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1989年3月-1999年2月，蒋建东在美国纽约大学西奈山医学院从事博士后研究，担任助理教授、医学系免疫室主任职务。
1999年2月-2010年10月，蒋建东担任中国医学科学院医药生物技术研究所研究员、病毒研究室主任、所长助理、副所长、所长。
2005年，蒋建东成为“全球重大卫生挑战计划”（GCGH，美国NIH/比尔盖兹基金会）第10主题项目首席专家（GCGH-#577项目）。
2010年10月-2021年1月，蒋建东担任中国医学科学院药物研究所所长。
2011年12月，蒋建东出任由药物研究所、医药生物技术研究所及药用植物研究所组成的中国医学科学院药物研究院首任院长。
2020年12月，蒋建东当选为中国医学科学院学部委员。
2021年11月，蒋建东当选为中国工程院院士。
从业之路解码
蒋建东院士在南京市儿童医院的工作经历，为他提供了宝贵的临床实践机会。
这段时间，他作为住院医师，直接面对患者，积累了大量的临床经验。
