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还有一种可能，清虚元妙真君并非一劫仙人，而是二劫仙人，那么一百六十年的时间差就变得十分充裕了。
至于二劫仙人为何不能振兴道门，道理也很简单，因为当时的儒门有一位同样渡过了二次天劫的圣人——心学圣人。
心学圣人在世时，曾化身为朝廷官员，平定道门发动的宁王之乱，镇压道门仙人众多，并将其称之为“山中贼”，受封伯爵。
其实仙人、圣人、佛陀、菩萨在世俗中有另外一个身份，是十分正常之事。林灵素成为大晋国师是一个例子，心学圣人平定宁王之乱也是一个例子，还有太上道祖化身为大周守藏室的官吏，以此契机点化还未“得道”的儒门至圣先师。
佛门这边也有类似例子，比如佛门大势至菩萨化身明空女帝，先做皇后，后来直接篡夺了道门李氏皇族的江山，强迫道士剃度为僧人，尊崇佛门。此举也引来了道门仙人的反击，五位道门仙人入朝，联手逼迫明空女帝退位，打破其人间之身，使其重归佛国成为大势至菩萨，还政于李氏皇族，史称五王。
直到玄圣出世，打破了这个惯例。
玄圣认为这种干涉只是隔靴搔痒，于事无补，他一直笃信人定胜天的道理，于是他整合道门，归纳传承，发展造物，建立金阙道府体系和九品制度，摒弃各种传统规矩，从幕后来到台前，直接插手干预世道发展。
于是纠缠了上千年的三教之争立时分出了胜负，面对焕然一新的道门，佛门和儒门相继战败，儒门成为附庸，佛门退居西域。
